Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r80L7N1Z3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r80L7N1Z3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r80L7N1Z3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r80L7N1Z3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r80L7N1Z3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms