Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms