Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm21797J3QNW5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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