Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms