Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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