Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20696H3BJN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20696H3BJN7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms