Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp6G5E8P0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms