Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcf11G3X9Z4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms