Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms