Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd3G3X8R9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd3G3X8R9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms