Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r167G3UW71 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms