Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms