Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScaperF8VQ70 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms