Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Colca2F8VPY8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms