Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28048F7BCN0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28048F7BCN0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28048F7BCN0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28048F7BCN0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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