Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2bF7BCK0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2bF7BCK0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms