Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8220F6YKI2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm8220F6YKI2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms