Protein–RNA interactions for Protein: F6W8I0

Yjefn3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yjefn3F6W8I0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Yjefn3F6W8I0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yjefn3F6W8I0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms