Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm340F6RGI3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms