Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prl3d2F6R3P9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3d2F6R3P9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms