Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms