Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp17lbE9Q9U0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lbE9Q9U0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms