Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rdh16f1E9Q9P8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh16f1E9Q9P8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh16f1E9Q9P8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh16f1E9Q9P8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh16f1E9Q9P8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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