Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TrdnE9Q9K5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TrdnE9Q9K5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms