Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp31E9Q6Y8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms