Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Simc1E9Q6E9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms