Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DspE9Q557 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms