Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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