Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpfE9Q3P4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CenpfE9Q3P4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms