Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

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Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cep350E9Q309 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Cep350E9Q309 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Cep350E9Q309 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Cep350E9Q309 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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Cep350E9Q309 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Cep350E9Q309 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep350E9Q309 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms