Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3095E9Q058 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3095E9Q058 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3095E9Q058 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3095E9Q058 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3095E9Q058 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms