Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scaf11E9PZM7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf11E9PZM7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms