Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkhd1E9PZ36 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkhd1E9PZ36 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms