Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp4E9PYK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms