Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ift140E9PY46 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ift140E9PY46 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms