Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms