Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcn1E9PVA8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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