Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifit3bE9PV48 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms