Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde2E9PUP1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms