Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Piezo1E2JF22 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Piezo1E2JF22 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Piezo1E2JF22 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Piezo1E2JF22 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Piezo1E2JF22 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Piezo1E2JF22 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Piezo1E2JF22 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Piezo1E2JF22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Piezo1E2JF22 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms