Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms