Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl3E0CZ16 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl3E0CZ16 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms