Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930407I10RikD3Z5T8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930407I10RikD3Z5T8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930407I10RikD3Z5T8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 340.5 ms