Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hfm1D3Z4R1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hfm1D3Z4R1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms