Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms