Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms