Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf217D3YYI7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf217D3YYI7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf217D3YYI7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf217D3YYI7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf217D3YYI7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Rnf217D3YYI7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf217D3YYI7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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