Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms