Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc13D3YV10 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms