Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3259D3YUK0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3259D3YUK0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms